Een kraamkolonie meervleermuizen is heel selectief in het kiezen van een verblijfplaats. De groep kiest bij voorkeur een plek waarin ze zowel koele als warme plekken kunnen vinden. Dit doen ze door binnen een verblijfplaats te kruipen, dit kan tot 60 meter afstand zijn. Een kerk of een rijtjeshuis zijn hiervoor erg geschikt. De spouwmuren van een huis zijn relatief koel en blijven als ze zijn opgewarmd lang op temperatuur. Onder de dakpannen vinden ze juist warme plekken. Ze hebben altijd een spouw en pannen gezamenlijk nodig,